{"id":4800,"date":"2019-06-27T07:36:42","date_gmt":"2019-06-27T07:36:42","guid":{"rendered":"https:\/\/www.enago.com\/academy\/br\/?p=4800"},"modified":"2020-11-27T12:53:56","modified_gmt":"2020-11-27T12:53:56","slug":"biological-databases-an-overview-and-future-perspectives","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.enago.com\/academy\/br\/biological-databases-an-overview-and-future-perspectives\/","title":{"rendered":"Bases de dados biol\u00f3gicas: vis\u00e3o geral e perspectivas futuras"},"content":{"rendered":"<p>As bases de dados biol\u00f3gicas surgiram como uma resposta \u00e0 enorme quantidade de dados gerada pelas <a href=\"https:\/\/www.ncbi.nlm.nih.gov\/pmc\/articles\/PMC4411498\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener noreferrer\">tecnologias de sequenciamento de DNA de baixo custo<\/a>.\u00a0Uma das primeiras bases de dados a surgir foi o GenBank, que \u00e9 uma cole\u00e7\u00e3o de todas as sequ\u00eancias conhecidas de prote\u00ednas e DNA. \u00c9 mantida pelo Institutos Nacionais de Sa\u00fade dos EUA (NIH) e pelo Centro Nacional de Informa\u00e7\u00f5es sobre Biotecnologia (NCBI). O GenBank preparou o caminho para o Projeto Genoma Humano (PGH). O PGH permitiu o sequenciamento completo e a leitura do c\u00f3digo gen\u00e9tico humano. Os dados armazenados em bases de dados biol\u00f3gicas s\u00e3o organizados de forma a permitir uma an\u00e1lise otimizada e s\u00e3o de dois tipos: brutos e processados (ou anotados). As bases de dados biol\u00f3gicas s\u00e3o complexas, heterog\u00eaneas e din\u00e2micas, mas inconsistentes. A inconsist\u00eancia \u00e9 devida \u00e0 <a href=\"https:\/\/bioinfo.kmu.edu.tw\/Bioinfo-db-general.pdf\" target=\"_blank\" rel=\"noopener noreferrer\">falta de padr\u00f5es no n\u00edvel ontol\u00f3gico<\/a>.<\/p>\n<div id=\"om-ip4ifef5zsek0u4xs4wb-holder\"><\/div>\n<p><script type=\"text\/javascript\" src=\"https:\/\/a.omappapi.com\/app\/js\/api.min.js\" data-campaign=\"ip4ifef5zsek0u4xs4wb\" data-user=\"41855\" async><\/script><\/p>\n<div id=\"ez-toc-container\" class=\"ez-toc-v2_0_74 counter-hierarchy ez-toc-counter ez-toc-grey ez-toc-container-direction\">\n<div class=\"ez-toc-title-container\">\n<p class=\"ez-toc-title\" style=\"cursor:inherit\">Table of Contents<\/p>\n<span class=\"ez-toc-title-toggle\"><a href=\"#\" class=\"ez-toc-pull-right ez-toc-btn ez-toc-btn-xs ez-toc-btn-default ez-toc-toggle\" aria-label=\"Toggle Table of Content\"><span class=\"ez-toc-js-icon-con\"><span class=\"\"><span class=\"eztoc-hide\" style=\"display:none;\">Toggle<\/span><span class=\"ez-toc-icon-toggle-span\"><svg style=\"fill: #999;color:#999\" xmlns=\"http:\/\/www.w3.org\/2000\/svg\" class=\"list-377408\" width=\"20px\" height=\"20px\" viewBox=\"0 0 24 24\" fill=\"none\"><path d=\"M6 6H4v2h2V6zm14 0H8v2h12V6zM4 11h2v2H4v-2zm16 0H8v2h12v-2zM4 16h2v2H4v-2zm16 0H8v2h12v-2z\" fill=\"currentColor\"><\/path><\/svg><svg style=\"fill: #999;color:#999\" class=\"arrow-unsorted-368013\" xmlns=\"http:\/\/www.w3.org\/2000\/svg\" width=\"10px\" height=\"10px\" viewBox=\"0 0 24 24\" version=\"1.2\" baseProfile=\"tiny\"><path d=\"M18.2 9.3l-6.2-6.3-6.2 6.3c-.2.2-.3.4-.3.7s.1.5.3.7c.2.2.4.3.7.3h11c.3 0 .5-.1.7-.3.2-.2.3-.5.3-.7s-.1-.5-.3-.7zM5.8 14.7l6.2 6.3 6.2-6.3c.2-.2.3-.5.3-.7s-.1-.5-.3-.7c-.2-.2-.4-.3-.7-.3h-11c-.3 0-.5.1-.7.3-.2.2-.3.5-.3.7s.1.5.3.7z\"\/><\/svg><\/span><\/span><\/span><\/a><\/span><\/div>\n<nav><ul class='ez-toc-list ez-toc-list-level-1 ' ><li class='ez-toc-page-1 ez-toc-heading-level-2'><a class=\"ez-toc-link ez-toc-heading-1\" href=\"https:\/\/www.enago.com\/academy\/br\/biological-databases-an-overview-and-future-perspectives\/#Por_que_essas_bases_de_dados_sao_importantes\" >Por que essas bases de dados s\u00e3o importantes?<\/a><\/li><li class='ez-toc-page-1 ez-toc-heading-level-2'><a class=\"ez-toc-link ez-toc-heading-2\" href=\"https:\/\/www.enago.com\/academy\/br\/biological-databases-an-overview-and-future-perspectives\/#Tipos_de_bases_de_dados_biologicas\" >Tipos de bases de dados biol\u00f3gicas<\/a><\/li><li class='ez-toc-page-1 ez-toc-heading-level-2'><a class=\"ez-toc-link ez-toc-heading-3\" href=\"https:\/\/www.enago.com\/academy\/br\/biological-databases-an-overview-and-future-perspectives\/#O_futuro\" >O futuro<\/a><\/li><\/ul><\/nav><\/div>\n<h2><span class=\"ez-toc-section\" id=\"Por_que_essas_bases_de_dados_sao_importantes\"><\/span>Por que essas bases de dados s\u00e3o importantes?<span class=\"ez-toc-section-end\"><\/span><\/h2>\n<p>Antigamente, os termos \u201cbase de dados\u201d e \u201cbanco de dados\u201d eram considerados bastante diferentes. No entanto, ao longo do tempo, \u201cbase de dados\u201d tornou-se um termo prefer\u00edvel. <a href=\"https:\/\/77.235.253.122\/tutorials\/wp-content\/uploads\/2014\/11\/databases.pdf\" target=\"_blank\" rel=\"noopener noreferrer\">Os dados s\u00e3o enviados diretamente<\/a> para bases de dados biol\u00f3gicas para indexa\u00e7\u00e3o, organiza\u00e7\u00e3o e otimiza\u00e7\u00e3o. As bases de dados ajudam os pesquisadores a encontrar dados biol\u00f3gicos relevantes, disponibilizando-os em um formato leg\u00edvel em um computador. Todas as informa\u00e7\u00f5es biol\u00f3gicas s\u00e3o prontamente acess\u00edveis atrav\u00e9s de ferramentas de minera\u00e7\u00e3o de dados que economizam tempo e recursos. As bases de dados biol\u00f3gicas podem ser classificadas como bases de dados <a href=\"https:\/\/iasri.res.in\/ebook\/win_school_aa\/notes\/Biological_Databases.pdf\" target=\"_blank\" rel=\"noopener noreferrer\">de sequ\u00eancias e de estruturas<\/a>. Bases de dados de estrutura s\u00e3o para estruturas de prote\u00ednas, enquanto bases de dados de sequ\u00eancias s\u00e3o para sequ\u00eancias de \u00e1cidos nucleicos e prote\u00ednas.<\/p>\n<h2><span class=\"ez-toc-section\" id=\"Tipos_de_bases_de_dados_biologicas\"><\/span>Tipos de bases de dados biol\u00f3gicas<span class=\"ez-toc-section-end\"><\/span><\/h2>\n<p>As bases de dados biol\u00f3gicas podem ser ainda classificadas em prim\u00e1rias, secund\u00e1rias e compostas.<\/p>\n<p>As bases de dados prim\u00e1rias cont\u00eam informa\u00e7\u00f5es apenas de sequ\u00eancias ou estruturas. Exemplos de bancos de dados biol\u00f3gicos prim\u00e1rios incluem:<\/p>\n<ul>\n<li>Swiss-Prot e PIR para sequ\u00eancias de prote\u00ednas<\/li>\n<li>GenBank e DDBJ para sequ\u00eancias de genoma<\/li>\n<li>Protein Databank para estruturas de prote\u00ednas<\/li>\n<\/ul>\n<p>Bases de dados secund\u00e1rias cont\u00eam informa\u00e7\u00f5es derivadas de bases de dados prim\u00e1rias. Elas armazenam informa\u00e7\u00f5es como, por exemplo, sequ\u00eancias conservadas, res\u00edduos de s\u00edtio ativo e sequ\u00eancias de assinatura. Os dados do Protein Databank s\u00e3o armazenados em bancos de dados secund\u00e1rios. Alguns exemplos:<\/p>\n<ul>\n<li>SCOP na Universidade de Cambridge<\/li>\n<li>CATH no University College London<\/li>\n<li>PROSITE do Instituto Su\u00ed\u00e7o de Bioinform\u00e1tica<\/li>\n<li>eMOTIF em Stanford<\/li>\n<\/ul>\n<p>Bases de dados compostas cont\u00eam uma variedade de bases de dados prim\u00e1rias, o que elimina a necessidade de pesquisar cada uma separadamente. Cada base de dados composta tem diferentes algoritmos de busca e estruturas de dados. O NCBI hospeda essas bases de dados, onde podem ser encontrados links para a Heran\u00e7a Mendeliana Humana <em>On-Line<\/em> (OMIM).<\/p>\n<h2><span class=\"ez-toc-section\" id=\"O_futuro\"><\/span>O futuro<span class=\"ez-toc-section-end\"><\/span><\/h2>\n<p>Com o advento de plataformas computacionais de alto desempenho, essas bases de dados tornaram-se importantes porque fornecem uma infraestrutura necess\u00e1ria para a pesquisa biol\u00f3gica contempor\u00e2nea, desde a prepara\u00e7\u00e3o de dados at\u00e9 a sua extra\u00e7\u00e3o. A simula\u00e7\u00e3o de sistemas biol\u00f3gicos tamb\u00e9m requer plataformas computacionais, o que refor\u00e7a a necessidade de bases de dados biol\u00f3gicas. O futuro das bases de dados biol\u00f3gicas parece brilhante, em parte por causa do mundo digital.<\/p>\n<p>Em termos de pesquisa, ferramentas de Bioinform\u00e1tica devem ser otimizadas para analisar a crescente quantidade de dados gerados a partir da Gen\u00f4mica, Metabol\u00f4mica, Prote\u00f4mica e Metagen\u00f4mica. Outra tend\u00eancia futura \u00e9 a anota\u00e7\u00e3o de dados existentes e uma melhor integra\u00e7\u00e3o das bases de dados.<\/p>\n<p>Com um grande n\u00famero de bases de dados biol\u00f3gicas dispon\u00edveis, a necessidade de integra\u00e7\u00e3o, avan\u00e7os e melhorias na Bioinform\u00e1tica \u00e9 primordial. A Bioinform\u00e1tica avan\u00e7ar\u00e1 de forma consistente quando forem abordados os problemas existentes de nomenclatura e padroniza\u00e7\u00e3o. O crescimento das bases de dados biol\u00f3gicas abrir\u00e1 caminho para mais estudos sobre prote\u00ednas e \u00e1cidos nucleicos, impactando os campos terap\u00eautico, biom\u00e9dico e outros relacionados. Se voc\u00ea usar bases de dados biol\u00f3gicas e quiser compartilhar alguma informa\u00e7\u00e3o, comente na se\u00e7\u00e3o abaixo!<\/p>\n<!-- AddThis Advanced Settings generic via filter on the_content --><!-- AddThis Share Buttons generic via filter on the_content -->","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>As bases de dados biol\u00f3gicas surgiram como uma resposta \u00e0 enorme quantidade de dados gerada [&hellip;]<!-- AddThis Advanced Settings generic via filter on get_the_excerpt --><!-- AddThis Share Buttons generic via filter on get_the_excerpt --><\/p>\n","protected":false},"author":8214,"featured_media":4847,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"_acf_changed":false,"om_disable_all_campaigns":false,"footnotes":""},"categories":[5,24],"tags":[714],"class_list":["post-4800","post","type-post","status-publish","format-standard","has-post-thumbnail","hentry","category-career-corner","category-product-service-reviews","tag-research-data-management"],"acf":[],"single_webinar_page_date":null,"single_webinar_page_time":null,"session_agenda":null,"who_should_attend_this_session":null,"about_the_speaker_field":null,"co-webinar-sec":null,"co_webinar_sec_one":null,"speaker-name":null,"webinar-date":null,"webinar-time":null,"webinar-s-image":null,"custum_webinar_category":null,"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.enago.com\/academy\/br\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/4800","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.enago.com\/academy\/br\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.enago.com\/academy\/br\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.enago.com\/academy\/br\/wp-json\/wp\/v2\/users\/8214"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.enago.com\/academy\/br\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=4800"}],"version-history":[{"count":3,"href":"https:\/\/www.enago.com\/academy\/br\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/4800\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":5903,"href":"https:\/\/www.enago.com\/academy\/br\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/4800\/revisions\/5903"}],"wp:featuredmedia":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.enago.com\/academy\/br\/wp-json\/wp\/v2\/media\/4847"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www.enago.com\/academy\/br\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=4800"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.enago.com\/academy\/br\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=4800"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.enago.com\/academy\/br\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=4800"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}